Los hombres que tienen relaciones con hombres están expuestos a la transmisión del VPH, una enfermedad notoria por ser una causa del cáncer anal. Un estudio se realizó para examinar la eficacia de la vacuna del VPH (Gardasil®) en la prevención de los cambios corporales que preceden el cáncer anal. Previo al desarrollo del cáncer, ocurren cambios dentro de las células infectadas con el VPH. Estos cambios son visibles, pues se observan en la apariencia y en el comportamiento del tejido. Estos cambios provocan un nuevo tipo de crecimiento de las células afectadas, y como resultado, se da una neoplasia intraepitelial (intra = dentro de, el término epitelial se refiere a las células que bordean la superficie de los órganos, neo = nuevo, plasia = crecimiento).
El estudio demostró que la vacuna puede reducir el desarrollo de estos cambios. Por ende, es probable que la vacuna también puede proteger en contra del desarrollo del cáncer anal.